めも

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エラー解決:Anaconda環境でauto-sklearnをインストール

エラー内容

python2.7, 3.5にて、OSはMac OS X.

auto-sklearnのドキュメントにしたがって Anaconda以下で指定の手順でauto-sklearnをインストールすると、 以下のエラーで止まってしまった。

ted_api.h:15:2: warning: "Using deprecated NumPy API, disable it by "          "#defining NPY_NO_DEPRECATED_API NPY_1_7_API_VERSION" [-W#warnings]
    #warning "Using deprecated NumPy API, disable it by " \
     ^
    pyrfr/regression.cpp:496:10: fatal error: 'random' file not found
    #include <random>
             ^
    1 warning and 1 error generated.
    error: command 'gcc' failed with exit status 1
    
    ----------------------------------------
Command "/Users/ユーザー名/anaconda/envs/python27/bin/python -u -c "import setuptools, tokenize;__file__='/private/var/folders/yp/khbks_h91tlbdvqxnxyqtv5m0000gp/T/pip-build-g8wAgb/pyrfr/setup.py';f=getattr(tokenize, 'open', open)(__file__);code=f.read().replace('\r\n', '\n');f.close();exec(compile(code, __file__, 'exec'))" install --record /var/folders/yp/khbks_h91tlbdvqxnxyqtv5m0000gp/T/pip-jCTD7x-record/install-record.txt --single-version-externally-managed --compile" failed with error code 1 in /private/var/folders/yp/khbks_h91tlbdvqxnxyqtv5m0000gp/T/pip-build-g8wAgb/pyrfr/

インストール手順

python2.7にて以下の手順でインストール成功。

環境に入る

$ source activate python27env 

gccをインストール

conda install gcc

(必要なら)以下のライブラリをアンインストール

pip uninstall pyrfr
pip uninstall auto-sklearn

auto-sklearnのインストール

$ curl https://raw.githubusercontent.com/automl/auto-sklearn/master/requirements.txt | xargs -n 1 -L 1 pip install
$ pip install auto-sklearn

追記

参考文献

What is auto-sklearn? — AutoSklearn 0.2.0 documentation

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